目前，在制药领域，生物药得到越来越多的关注。生物药是利用DNA重组、细胞融合、细胞培养等生物技术开发出的蛋白质药物、抗体药物等。几乎所有蛋白质合成都起始于N-末端，其序列组成对于蛋白质整体的生物学功能有着重要的影响力，因此蛋白质的序列分析对于生物药效果非常关键。目前，2015版《中国药典》三部人用重组DNA技术产品总论对生物药的生产及质量控制方面，针对其蛋白质结构提出技术要求，应测定目标产品的氨基酸序列，并与其基因序列推断的理论氨基酸序列进行比较。因此，N-末端氨基酸序列分析是很多已上市生物药的年检项目，如重组人促红素注射液（CHO细胞）、重组人粒细胞刺激因子注射液等。此外，国际法规中也有对于

使用LCMS-IT-TOF对食品中的未知添加色素进行分析，根据其多级质谱数据进行结构分析，确定添加的未知色素为一种偶氮类染料。

2010年10月7日在澳大利亚悉尼召开的第九届亚太烟草或健康会议上，发布的一项中国与其他国家烟草的对比研究表明：中国产的13个牌子卷烟检测出含有重金属。烟草中含有的铅、砷和镉等重金属成分，其含量与加拿大产香烟相比，最高超出三倍以上。烟草中有害金属的含量以及对人体健康的影响，近年来越来越受到各国研究人员的关注。虽说与要求严苛的加拿大烟草作比较确实有失公平，但中国烟草重金属含量高于其他国家烟草，却是一个不争的事实。