本文采用Nexera XS Inert生物惰性超高效液相色谱和单四极杆质谱LCMS-2050联用仪对mRNA和DNA生产用核苷酸原料NTP和dNTP进行定性分析。NTP和dNTP中含磷酸基团，易与金属产生吸附作用，Nexera XS Inert在保证超高耐压的前提下，管路经peek材料内衬，实现全流路惰性化，抑制金属吸附，使NTP和dNTP的色谱峰型良好。通过优化流动相和质谱采集参数，采用DUIS（ESI+APCI）离子源的负离子模式分析待测样品。结果显示，该方法无需复杂的样品前处理、操作简单，检测的NTP和dNTP色谱峰型良好且均有较好的保留，适用于mRNA和DNA原料进厂质控分析，可对其原料进行快速分子量确认。