作为含砷化合物，雄黄（As4S4）既是已知的毒药又是一种治疗试剂。然而，对于伴随着雄黄疗效和毒性的准确生物化学变化缺乏完整的理解。在代谢组学方法的基础上，结合超快速液相色谱（UFLC）串联离子阱飞行时间质谱（IT-TOF/MS）和氢谱，我们能够很明显地识别出雄黄给药的大鼠尿液样本中代谢物。对液相色谱/质谱和核磁共振技术平台的稳定性进行了系统地研究，对数据处理方法也进行了仔细地优化。我们的研究结果表明，在氨基酸代谢、柠檬酸循环、胆碱代谢和卟啉代谢中出现了明显的紊乱。提出了三十六种代谢产物，作为雄黄引起紊乱相关的潜在安全标志物，而甘氨酸和丝氨酸有望作为与雄黄诱导紊乱相关的代谢途径的中心触点。基于代谢组学的液质联用和核磁共振氢谱方法，提供了一个关于雄黄对大鼠生化作用的系统的、整体的观点，未来也可用于其它药物或外源性物质的研究。