药代动力学是对药物在生物体内吸收、分布、生物转化、排泄等一系列过程定量研究的学科。药代动力学研究的难点在于建立选择性强、精密度和准确度高、灵敏、快速的分析方法，测定生物样品（通常为血浆样品）中的微量药物和代谢产物浓度。生物样本定量分析方法常用的包括色谱法，例如气相色谱、液相色谱、气质联用、液质联用等；免疫学方法，例如放射免疫分析、酶联免疫分析、荧光免疫分析等，此类方法多用于蛋白多肽类药物检测；微生物学方法，可用于抗生素药物检测。生物样本分析方法的选择应尽可能选择可行的灵敏度高、选择性好的方法。

当微生物分解物质以产生有用物质时，该过程称为发酵。发酵工艺不仅用于生产食品，近年来还广泛用于工业领域。在工业领域中，对有机酸类、糖类、氨基酸类和其他组化合物进行多边测量，以了解发酵过程或优化条件。在HPLC分析的情况下，适当的分离模式和检测方法可能会因成分类别而有所不同。这就要求每次分析时使用多台独立的设备。本文介绍了一个利用双进样系统监测发酵过程的实例，用一个系统同时评估两种类型的分析。

中药材对治疗疾病有很好的效果，然而近年来中药材品种混淆使用问题屡有发生，有的是名称相似易混，有的是外形相似易混，有的则因价格差故意掺混。由于不同品种中药材药效有差异，中药材品种的掺伪势必会对人们的健康造成影响。2015版《中国药典》中明确规定了一些方剂中药品种的来源及易混淆的不同品种中药材的分别收录，如金银花和山银花，为了保证用药安全，准确地鉴定中药材的品种非常关键。目前采用感官和化学分析仪器检测中药材品种，对于某些品种难以准确测定。2015版《中国药典》中采用PCR结合电泳检测方法对川贝母、蕲蛇饮片和乌梢蛇饮片进行鉴别检查，且首次加入了《中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则》。