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微芯片电泳MultiNA分析异源双链迁移率(Heteroduplex Mobility Assay)
微芯片电泳MultiNA分析异源双链迁移率(Heteroduplex Mobility Assay)
随着利用转录激活样效应因子核酸酶(Transcription Activator-Like Effector Nuclease)和CRISPR/CAS9 (Clustered Regularly InterspacedShort Palindromic Repeats/CRISPR Associated Proteins 9)的基因组编辑工具的诞生,使得对靶基因进行特异性的破坏和引入基因成为可能。由于能适用于微生物、动物、植物等过去难以进行基因修饰的生物,因此其普及速度十分迅速。评估靶部位有无发生突变的方法包括直接分析序列的方法以及使用酶识别切割不匹配双链的方法,无论哪种方法均费时费力,成本相对较高。HMA(异源双链迁移率分析)是一种简便、迅速、以低成本实施的方法(图1)。在通常的电泳中,DNA是完全互补的同源双链体,其迁移率取决于分子量(大小)。另一方面,双链中其中一条链的一部分发生了突变的DNA,其不匹配的部分不形成互补链,而是成为异源双链DNA。异源双链DNA的不匹配部分与同源双链DNA具有不同的立体结构。因此,异源双链DNA在电泳中呈迁移率较低的趋势。HMA能利用上述现象测定有无发生突变,并通过电泳判断基因型。本应用程序将使用模型DNA,通过DNA/RNA分析用微芯片电泳装置MCE-202 MultiNA,对异源双链迁移率HMA(Heteroduplex Mobility Assay)检测的分析例进行介绍。 Sogabe
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