核酸类药物是为结合特异性靶RNA和蛋白质设计的合成寡核苷酸。在此之前获得批准的核酸类药物大多是反义型，此外，还有适体型和siRNA型获得了批准。大多数的核酸类药物为20个碱基左右，分子量为6000左右。通常使用MALDI-TOF型、Q-TOF型质谱仪等的精密质谱分析来确认原料药的分子量。另一方面，在血液药代动力学分析等的定量分析中，一般使用灵敏度高、动态范围大的三重四极杆质谱仪。本文中为您介绍假定分析siRNA型核酸类药物的原料药，使用三重四极杆质谱仪LCMS-8060分析合成双链寡核苷酸的案例。确认了SIM（Selected ion monitoring）的定量性能。在使用SIM模式绘制标准曲线时，得到了1 fmol～10 pmol范围内的线性。另外，多电荷离子通过解卷积分析确认了分子量。